Esimene HIVi juhtum diagnoositi Eestis 1988. aastal, sellest ajast alates on registreeritud 9263 HIVi nakatunut. Uute diagnoositud juhtumite arv on viimase 10 aasta jooksul vähenenud (2005.
aasta 46,0 juhtumilt 100 000 inimese kohta 2015. aasta 20,5 juhtumile), kuid viimasel paaril aastal on määr olnud suhteliselt stabiilne (2013. aastal 25 juhtumit 100 000 inimese kohta ja 2014. aastal 23). HIVi edasikandumine hetero- ja homoseksuaalsel teel on sagenenud, samuti on suurenenud vanemate kui 34aastaste nakatunud inimeste osakaal.